ICDD&束蘊儀器丨探索新冠*藥，我們在行動(dòng)

衍射數據中心（ICDD）解析出一種可用于治療新冠肺炎COVID-19的潛在藥物Atazanavir的晶體結構。

 

隨著(zhù)新冠病毒的蔓延，*醫學(xué)研究人員都在努力尋找用于治療新冠肺炎的*藥，Atazanavir（阿扎那韋，C38 H52 N6 O7）是一種能夠有效治療SARS-CoV-2病毒的藥物。相關(guān)研究表明，Atazanavir有可能對抗新冠病毒COVID-19也具有一定的療效。2015年，ICDD-PDF數據庫收錄了Atazanavir粉末衍射圖及二維分子式（見(jiàn)PDF No. 00-065-1426），并于2017年修正了該物相的F因子。

 

僅僅知悉藥物的二維分子式，對于研究藥物對抗病毒的機理，還遠遠不夠，迫切需要解析Atazanavir的晶體結構，來(lái)深入研究該藥物對抗新冠病毒的療效顯得尤為重要。近ICDD執行主席Thomas Blanton 、PDF數據庫編輯Amy Gindhart和其合作者伊利諾伊理工學(xué)院的James Kaduk基于PDF卡片數據庫中出版的Atazanavir標準衍射卡片，共同解析出了室溫下Atazanavir的晶體結構，為醫學(xué)工作者研究新冠病毒COVID-19的治療方案提供了巨大的幫助，極大的推進(jìn)了探索Atazanavir治療新冠病毒的可行性。

采用同步輻射的方法，收集了純相的Atazanavir的衍射圖，基于Rietveld精修理論，使用JADE（ICDD-MDI）軟件對其進(jìn)行了指標化，Atazanavir屬于單斜晶系，空間群為P2₁，晶胞參數為a = 15.331, b = 5.902, c = 21.562 ?, β = 96.3°; 原胞體積為1939.3 ?³。

 

采用密度泛函理論（Densityfunctional theory，DFT），對Atazanavir的晶體結構能量計算進(jìn)而優(yōu)化晶體結構，以尋求優(yōu)的晶體結構。同時(shí)結合Rietveld精修的結果，對Atazanavir晶體結構進(jìn)行解析。下圖為Rietveld精修和DFT理論優(yōu)化的Atazanavir晶體結構的對比，相關(guān)的均方根約為0.077 。

 

進(jìn)一步，解析出Atazanavir的三維結構如下圖所示：